2011.8月5日更新
| 深圳地铁5号线运营时刻表（官方最新数据） | 发车间隔 | |||||
| 车站 | 首班 | 末班 | 首班 | 末班 | 高峰 | 平峰 |
| 前海湾方向 | 黄贝岭方向 | |||||
| 前海湾站 | － | － | 6：30 | 23：00 | 9分钟 | 9分钟 |
| 临海站 | 7：04 | 00：04 | 6：32 | 23：02 | 9分钟 | 9分钟 |
| 宝华站 | 7：02 | 00：02 | 6：34 | 23：04 | 9分钟 | 9分钟 |
| 宝安中心站 | 7：01 | 00：00 | 6：36 | 23：06 | 9分钟 | 9分钟 |
| 翻身站 | 6：59 | 23：58 | 6：37 | 23：07 | 9分钟 | 9分钟 |
| 灵芝站 | 6：56 | 23：55 | 6：40 | 23：10 | 9分钟 | 9分钟 |
| 红浪北站 | 6：54 | 23：53 | 6：42 | 23：12 | 9分钟 | 9分钟 |
| 兴东站 | 6：52 | 23：51 | 6：44 | 23：14 | 9分钟 | 9分钟 |
| 留仙洞站 | 6：48 | 23：48 | 6：48 | 23：18 | 9分钟 | 9分钟 |
| 西丽站 | 6：46 | 23：46 | 6：50 | 23：20 | 9分钟 | 9分钟 |
| 大学城站 | 6：44 | 23：43 | 6：52 | 23：22 | 9分钟 | 9分钟 |
| 塘朗站 | 6：40 | 23：39 | 6：56 | 23：26 | 9分钟 | 9分钟 |
| 长岭陂站 | 6：37 | 23：36 | 6：36 | 23：29 | 9分钟 | 9分钟 |
| 深圳北站 | 7：03 | 23：33 | 6：40 | 23：33 | 9分钟 | 9分钟 |
| 民治站 | 7：00 | 23：30 | 6：42 | 23：35 | 9分钟 | 9分钟 |
| 五和站 | 6：57 | 23：27 | 6：45 | 23：38 | 9分钟 | 9分钟 |
| 坂田站 | 6：55 | 23：25 | 6：41 | 23：40 | 9分钟 | 9分钟 |
| 杨美站 | 6：53 | 23：23 | 6：49 | 23：42 | 9分钟 | 9分钟 |
| 上水径站 | 6：49 | 23：19 | 6：53 | 23：46 | 9分钟 | 9分钟 |
| 下水径站 | 6：47 | 23：17 | 6：55 | 23：48 | 9分钟 | 9分钟 |
| 长龙站 | 6：45 | 23：15 | 6：57 | 23：50 | 9分钟 | 9分钟 |
| 布吉站 | 6：43 | 23：13 | 6：59 | 23：53 | 9分钟 | 9分钟 |
| 白鸽笼站 | 6：40 | 23：10 | 7：02 | 23：55 | 9分钟 | 9分钟 |
| 布心站 | 6：37 | 23：07 | 7：05 | 23：58 | 9分钟 | 9分钟 |
| 太安站 | 6：35 | 23：05 | 7：07 | 00：00 | 9分钟 | 9分钟 |
| 怡景站 | 6：32 | 23：02 | 7：10 | 00：03 | 9分钟 | 9分钟 |
| 黄贝岭站 | 6：30 | 23：00 | － | － | 9分钟 | 9分钟 |
